היוזמה אתרים קדושים טבעי מונחה על ידי אפוטרופסים ויועצים ממקצועות שונים תחומי החיים. כבסיס המנחה את הפיתוח של יוזמת אתרים קדושים טבעיים הם עושים שימוש של תוכנית פעולה ראשונית. תכנית פעולה זו פותחה על בסיס ניסיון של אפוטרופסים רבים, שימור אנשי מקצוע וקובעי מדיניות מכל רחבי העולם.
