Gulnara Aitpaeva é candidata em Estudos de Literatura pela Universidade Estadual de Moscou, URSS (1987) e doutorado em Literatura e Estudos Folclóricos pela Universidade Estadual Nacional do Quirguistão, Quirguistão (1996). Em 1996-2005, Gulnara A. Aitpaeva assumiu vários cargos na Universidade Americana na Ásia Central e contribuiu na construção de uma universidade de novo estilo no país.

Em 1999 ela fundou o Departamento de Etnologia do Quirguistão na Universidade Americana no Quirguistão, com a missão de desenvolver uma nova antropologia das ciências sociais. Em 2002 ela transformou este departamento no Departamento de Antropologia Cultural e Arqueologia para ampliar seu escopo e missão. Atualmente é diretora do Centro de Pesquisa Cultural Aigine, que foi fundada por ela em 2004 com a missão de expandir a investigação sobre aspectos menos conhecidos do património cultural e natural do Quirguizistão, integrando local, epistemologias esotéricas e acadêmicas relacionadas à cultura, diversidades biológicas e étnicas.

A partir de 2005 até 2008 Gulnara foi membro do Conselho da Sociedade de Estudos da Eurásia Central. Por cerca de cinco anos ela foi especialista da Comissão Estadual de Certificação da República do Quirguistão. Desde 2009 ela é professora interina do Departamento de Estudos Comparados de Língua e Literatura e do Departamento de Literatura Russa da Universidade Nacional do Quirguistão. Atualmente ela é consultora acadêmica do Departamento de Teoria da Literatura da Universidade Eslava do Quirguistão-Russa.. Desde 2012 ela atua como representante do país no comitê intergovernamental sobre patrimônio imaterial da UNESCO. Suas publicações recentes incluem um artigo sobre a espiritualidade tradicional do Quirguistão, publicado pela Continuum em 2011. Desde 2006 ela editou cinco livros sobre locais sagrados e conhecimentos tradicionais relacionados.