Gulnara Aitpaeva har en kandidatgrad i litteraturvitenskap fra Moscow State University, USSR (1987) og doktorgrad i litteratur- og folklorestudier fra Kyrgyz National State University, Kirgisistan (1996). I 1996-2005, Gulnara A. Aitpaeva tok forskjellige stillinger ved American University i Sentral-Asia og bidro til å bygge et universitet i ny stil i landet.

I 1999 hun grunnla den kirgisiske etnologiske avdelingen ved American University i Kirgisistan, med oppdraget å utvikle ny samfunnsvitenskapelig antropologi. I 2002 hun forvandlet denne avdelingen til Institutt for kulturantropologi og arkeologi for å utvide dens omfang og oppdrag. For tiden er hun direktør for Aigine Cultural Research Center, som ble grunnlagt av henne i 2004 med oppdraget å utvide forskningen på mindre kjente aspekter ved den kulturelle og naturlige arven i Kirgisistan, integrere lokalt, esoteriske og vitenskapelige epistemologier knyttet til kulturell, biologiske og etniske mangfold.

Fra 2005 inntil 2008 Gulnara var medlem av styret for Central Eurasian Study Society. I omtrent fem år pleide hun å være ekspert for den statlige attestasjonskommisjonen i Kirgisistan. Siden 2009 hun er fungerende professor ved avdelingen for sammenlignende språk- og litteraturstudier og den russiske litteraturavdelingen ved Kyrgyz National University. For tiden er hun akademisk rådgiver på litteraturteoriavdelingen ved Kirgisisk-russisk slavisk universitet. Siden 2012 hun fungerer som landsrepresentant i UNESCOs mellomstatlige komité for immateriell arv. Hennes nylige publikasjoner inkluderer en artikkel om kirgisisk tradisjonell spiritualitet, utgitt av Continuum i 2011. Siden 2006 hun har redigert fem bøker om hellige steder og relatert tradisjonell kunnskap.