Gulnara Aitpaeva jest absolwentką literaturoznawstwa na Moskiewskim Uniwersytecie Państwowym, ZSRR (1987) oraz stopień doktora w dziedzinie literatury i folkloru na Kirgiskim Narodowym Uniwersytecie Państwowym, Kirgistan (1996). W 1996-2005, Gulnara A. Aitpaeva zajmowała różne stanowiska na Uniwersytecie Amerykańskim w Azji Środkowej i przyczyniła się do zbudowania w kraju uniwersytetu nowego stylu.

W 1999 założyła Katedrę Etnologii Kirgiskiej na Uniwersytecie Amerykańskim w Kirgistanie, z misją rozwoju nowej antropologii nauk społecznych. W 2002 przekształciła tę katedrę w Katedrę Antropologii Kulturowej i Archeologii, aby rozszerzyć jej zakres i misję. Obecnie jest dyrektorem Centrum Badań Kulturowych w Aigine, który został przez nią założony w 2004 z misją poszerzania badań nad mniej znanymi aspektami dziedzictwa kulturowego i naturalnego Kirgistanu, integrujący lokalnie, epistemologie ezoteryczne i naukowe związane z kulturą, różnorodności biologicznej i etnicznej.

Z 2005 do 2008 Gulnara był członkiem zarządu Central Eurasian Study Society. Przez około pięć lat była ekspertem Państwowej Komisji Atestacyjnej Republiki Kirgiskiej. Ponieważ 2009 jest profesorem na Wydziale Porównawczych Studiów nad Językiem i Literaturą oraz na Wydziale Literatury Rosyjskiej na Kirgiskim Uniwersytecie Narodowym. Obecnie jest doradcą akademickim na Wydziale Teorii Literatury Kirgisko-Rosyjskiego Uniwersytetu Słowiańskiego. Ponieważ 2012 pełni funkcję przedstawicielki kraju w Międzyrządowym Komitecie ds. Dziedzictwa Niematerialnego UNESCO. Wśród jej ostatnich publikacji znajduje się artykuł na temat tradycyjnej duchowości kirgiskiej, opublikowane przez Continuum w 2011. Ponieważ 2006 zredagowała pięć książek na temat świętych miejsc i związanej z nimi wiedzy tradycyjnej.